Les Muffatti werd in 1996 opgericht door een groep jonge Brusselse musici die een professioneel barokorkest wilden creëren. Na tien jaar onder leiding van Peter Van Heyghen te hebben gewerkt, zijn de musici van het orkest nu collectief verantwoordelijk voor de artistieke leiding van het ensemble, waarbij ze niet aarzelen om de muzikale leiding van bepaalde projecten toe te vertrouwen aan gastmusici, terwijl ze een evenwicht bewaren tussen werken uit het grote repertoire en nieuwe ontdekkingen.
De naam van het orkest verwijst naar Georg Muffat (1653-1704), een componist en wereldburger die nauw verbonden is met de vroege geschiedenis van het orkest: Muffat was namelijk een van de eersten om de voornaamste karakteristieke verschillen van de Franse en Italiaanse stijl heel gedetailleerd te bepalen. De eerste opname van het ensemble was aan deze componist gewijd.
De discografie van Les Muffatti telt op vandaag tien opnames (op het label Ramée) die door de pers unaniem lof werden toegezwaaid. De opname van Reinhard Keisers Brockes-Passion, in samenwerking met het ensemble Vox Luminis, won alle drie de belangrijkste prijzen van België in 2014: de Klara Muziekprijs voor Beste Klassieke CD, de Caecilia Prijs van de Vereniging van de Belgische muziekpers en een Octave de la musique classique. De cd met reconstructies van Johann Sebastian Bachs concerti voor orgel en strijkers, met Bart Jacobs als solist (2019), werd bekroond met talrijke prijzen, waaronder de Diapason d'Or de l'Année in Frankrijk, Het Gouden Label en de Klara Muziekprijs voor cd van het jaar in België en Luister 10 in Nederland, en werd uitgeroepen tot CD des Monats door Toccata in Duitsland. Hun jongste cd, Bach Triple, met werken van Johann Sebastian Bach voor fluit, viool, klavecimbelsolisten en strijkorkest, werd uitgebracht in maart 2024.
Les Muffatti wordt gesteund door de Fédération Wallonie-Bruxelles.
