Na studies cello bij Paul Boufil besloot Emmanuel Bardon zich aan de zang te wijden. Na een opleiding bij Gaël de Kerret en aan de Maîtrise du Centre de Musique Baroque de Versailles bij Olivier Schneebeli en Maarten Köningsberger, behaalde hij in 1995 zijn hoger zangdiploma. Hij kreeg de kans om zich te vervolmaken bij Mireille Deguy, Ronald Klekampf, Montserrat Figueras, Jordi Savall, Maria-Cristina Kiehr, Margaret Hönig, Noëlle Barker en Jenifer Smith.Hij verleende zijn medewerking aan producties van ensembles zoals het Concert Spirituel (Hervé Niquet), La Capella Reial de Catalunya (Jordi Savall), Les Musiciens du Louvre (Marc Minkowski), Capriccio Stravagante (Skip Sempé), Le Parlement de Musique (Martin Gester), La Simphonie du Marais (Hugo Reyne)
Regelmatig wordt hij door de onderzoeksworkshop van het Centre de Musique Baroque de Versailles, Les Arts Florissants, Le Concert Spirituel of nog Le Parlement de Musique gevraagd om muzikale reconstructies uit te werken.In 1996 stichtte hij Canticum Novum, een ensemble dat sedert 2007 in residentie is in het Opéra-Théâtre de Saint-Etienne en waarmee hij in heel Frankrijk en daarbuiten concerteert.Emmanuel Bardon stichtte in 1999 het Festival Musique à Fontmorigny (Cher) waarvan hij tevens artistiek directeur is. Hij is daarnaast ook artistiek directeur van het label Fontmorigny.